Angewandte Genomik für Neurodegenerative Erkrankungen
Dr. Patrizia Rizzu
Gruppenleiterin
Otfried-Müller-Str. 23
72076 Tübingen

patrizia.rizzu@dzne.de
 +49 7071 9254-082

Forschungsschwerpunkte

Unser Labor war schon immer an der Untersuchung der molekularen Mechanismen interessiert, die der Krankheitsentstehung neurodegenerativer Erkrankungen wie der Frontotemporalen lobären Degeneration (FTLD) und der Parkinson-Krankheit (PD) zugrunde liegen.

In diesem Zusammenhang haben wir genetische Analysen zur Ermittlung von Genen durchgeführt, die für die selteneren, sporadischen Formen der Krankheiten verantwortlich sind, bei denen die Krankheit nach den Mendelschen Regeln vererbt wird. Darüber hinaus arbeiten wir auch an Studien, die das Ziel haben, den genetischen Beitrag zum ursächlichen Prozess und zur Pathogenese der häufigeren und komplexeren Formen neurodegenerativer Erkrankungen zu ermitteln. Bei den letztgenannten Formen erfolgt die Vererbung  selten gemäß den Mendelschen Regeln, sondern man geht davon aus, dass sie aus einer komplexen Wechselwirkung zwischen mehreren prädisponierenden Genen und anderen Faktoren, einschließlich Umwelteinflüssen und zufälligen Ereignissen, resultieren.

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Das endgültige Ziel unserer Forschung ist es, zelluläre Modelle zu schaffen, welche die spezifischen molekularen Aspekte der Krankheiten aufweisen und diese Modelle zu nutzen, um damit ideale Zielmoleküle für zukünftige Therapien zu finden.

Um einen Einblick in die Netzwerke krankheitsrelevanter nueronaler Prozesse zu gewinnen und wichtige Knotenpunkte dieser Prozesse zu identifizieren, haben wir uns für einen genomweiten omics Ansatz entschieden, der molekulare (omics) und zellbiologische (cellomiocs) Ansätze mit einer hohen Durchsatzrate kombiniert. Wir verwenden derzeit Hirngewebe, iPC- und NPC-Zellen von menschlichen Mutationsträgern, sporadischen Fällen und entsprechenden Mausmodellen. Verfügbare Träger jedes neu identifizierten Gens aus unseren gesamten Exom-/Genom-Sequenzierungsbemühungen werden ebenfalls berücksichtigt. Transkriptomische Ansätze zur Untersuchung der genomweiten RNA-Expression kodierender und nicht kodierender Transkripte werden durch proteomische und epigenetische Analysen, in Zusammenarbeit mit Forschungsgruppen des DZNE und internationalen Konsortien (FANTOM, IPDGC), ergänzt.

Schlüsselpublikationen

FANTOM Consortium and the RIKEN PMI and CLST (DGT), Forrest AR, Kawaji H, Rehli M, Baillie JK, de Hoon MJ, Haberle V, Lassmann T, Kulakovskiy IV, Lizio M, Itoh M, Andersson R, Mungall CJ, Meehan TF, Schmeier S, Bertin N, Jørgensen M, Dimont E, Arner E, Schmidl C, Schaefer U, Medvedeva YA, Plessy C, Vitezic M, Severin J, Semple C, Ishizu Y, Young RS, Francescatto M, Alam I, Albanese D, Altschuler GM, Arakawa T, Archer JA, Arner P, Babina M, Rennie S, Balwierz PJ, Beckhouse AG, Pradhan-Bhatt S, Blake JA, Blumenthal A, Bodega B, Bonetti A, Briggs J, Brombacher F, Burroughs AM, Califano A, Cannistraci CV, Carbajo D, Chen Y, Chierici M, Ciani Y, Clevers HC, Dalla E, Davis CA, Detmar M, Diehl AD, Dohi T, Drabløs F, Edge AS, Edinger M, Ekwall K, Endoh M, Enomoto H, Fagiolini M, Fairbairn L, Fang H, Farach-Carson MC, Faulkner GJ, Favorov AV, Fisher ME, Frith MC, Fujita R, Fukuda S, Furlanello C, Furino M, Furusawa J, Geijtenbeek TB, Gibson AP, Gingeras T, Goldowitz D, Gough J, Guhl S, Guler R, Gustincich S, Ha TJ, Hamaguchi M, Hara M, Harbers M, Harshbarger J, Hasegawa A, Hasegawa Y, Hashimoto T, Herlyn M, Hitchens KJ, Ho Sui SJ, Hofmann OM, Hoof I, Hori F, Huminiecki L, Iida K, Ikawa T, Jankovic BR, Jia H, Joshi A, Jurman G, Kaczkowski B, Kai C, Kaida K, Kaiho A, Kajiyama K, Kanamori-Katayama M, Kasianov AS, Kasukawa T, Katayama S, Kato S, Kawaguchi S, Kawamoto H, Kawamura YI, Kawashima T, Kempfle JS, Kenna TJ, Kere J, Khachigian LM, Kitamura T, Klinken SP, Knox AJ, Kojima M, Kojima S, Kondo N, Koseki H, Koyasu S, Krampitz S, Kubosaki A, Kwon AT, Laros JF, Lee W, Lennartsson A, Li K, Lilje B, Lipovich L, Mackay-Sim A, Manabe R, Mar JC, Marchand B, Mathelier A, Mejhert N, Meynert A, Mizuno Y, de Lima Morais DA, Morikawa H, Morimoto M, Moro K, Motakis E, Motohashi H, Mummery CL, Murata M, Nagao-Sato S, Nakachi Y, Nakahara F, Nakamura T, Nakamura Y, Nakazato K, van Nimwegen E, Ninomiya N, Nishiyori H, Noma S, Noma S, Noazaki T, Ogishima S, Ohkura N, Ohimiya H, Ohno H, Ohshima M, Okada-Hatakeyama M, Okazaki Y, Orlando V, Ovchinnikov DA, Pain A, Passier R, Patrikakis M, Persson H, Piazza S, Prendergast JG, Rackham OJ, Ramilowski JA, Rashid M, Ravasi T, Rizzu P, Roncador M, Roy S, Rye MB, Saijyo E, Sajantila A, Saka A, Sakaguchi S, Sakai M, Sato H, Savvi S, Saxena A, Schneider C, Schultes EA, Schulze-Tanzil GG, Schwegmann A, Sengstag T, Sheng G, Shimoji H, Shimoni Y, Shin JW, Simon C, Sugiyama D, Sugiyama T, Suzuki M, Suzuki N, Swoboda RK, 't Hoen PA, Tagami M, Takahashi N, Takai J, Tanaka H, Tatsukawa H, Tatum Z, Thompson M, Toyodo H, Toyoda T, Valen E, van de Wetering M, van den Berg LM, Verado R, Vijayan D, Vorontsov IE, Wasserman WW, Watanabe S, Wells CA, Winteringham LN, Wolvetang E, Wood EJ, Yamaguchi Y, Yamamoto M, Yoneda M, Yonekura Y, Yoshida S, Zabierowski SE, Zhang PG, Zhao X, Zucchelli S, Summers KM, Suzuki H, Daub CO, Kawai J, Heutink P, Hide W, Freeman TC, Lenhard B, Bajic VB, Taylor MS, Makeev VJ, Sandelin A, Hume DA, Carninci P, Hayashizaki Y. A promoter-level mammalian expression atlas. Nature. 2014 Mar 27; 507:462-70. doi: 10.1038/nature13182
Rizzu P, Hinkle DA, Zhukareva V, Bonifati V, Severijnen LA, Martinez D, Ravid R, Kamphorst W, Eberwine JH, Lee VM, Trojanowski JQ, Heutink P. DJ-1 colocalizes with tau inclusions: a link between parkinsonism and dementia. Ann Neurol. 2004 Jan 01; 55:113-8.
Bonifati V, Rizzu P, van Baren MJ, Schaap O, Breedveld GJ, Krieger E, Dekker MC, Squitieri F, Ibanez P, Joosse M, van Dongen JW, Vanacore N, van Swieten JC, Brice A, Meco G, van Duijn CM, Oostra BA, Heutink P. Mutations in the DJ-1 gene associated with autosomal recessive early-onset parkinsonism. Science. 2013 Jan 10; 299:256-9.
Rizzu P, Van Swieten JC, Joosse M, Hasegawa M, Stevens M, Tibben A, Niermeijer MF, Hillebrand M, Ravid R, Oostra BA, Goedert M, van Duijn CM, Heutink P. High prevalence of mutations in the microtubule-associated protein tau in a population study of frontotemporal dementia in the Netherlands. Am J Hum Genet. 1999 Feb 02; 64:414-21.
Hutton M, Lendon CL, Rizzu P*, Baker M, Froelich S, Houlden H, Pickering-Brown S, Chakraverty S, Isaacs A, Grover A, Hackett J, Adamson J, Lincoln S, Dickson D, Davies P, Petersen RC, Stevens M, de Graaff E, Wauters E, van Baren J, Hillebrand M, Joosse M, Kwon JM, Nowotny P, Che LK, Norton J, Morris JC, Reed LA, Trojanowski J, Basun H, Lannfelt L, Neystat M, Fahn S, Dark F, Tannenberg T, Dodd PR, Hayward N, Kwok JB, Schofield PR, Andreadis A, Snowden J, Craufurd D, Neary D, Owen F, Oostra BA, Hardy J, Goate A, van Swieten J, Mann D, Lynch T, Heutink P *joint first author. Association of missense and 5'-splice-site mutations in tau with the inherited dementia FTDP-17. Nature. 1998 Jun 18; 393:702-5.

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