Dr. Ashraf Al-Amoudi

Gruppenleiter
Dr. Al-Amoudi leitet eine gemeinsame Forschergruppe des DZNE und des Forschungszentrums caesar

Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen (DZNE)
Ludwig-Erhard-Allee 2
53175 Bonn

ashraf.al-amoudi(at)dzne.de
+49 (0) 228 / 43302-550

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Gruppenmitglieder Curriculum Vitae

Forschungsschwerpunkte

Ziel unserer Arbeitsgruppe ist es die folgenden Punkte unter der Verwendung von konventioneller Kryo-Elektronenmikroskopie und -tomographie von kultivierten Zellen oder primären Zelllinien aus Modellsystemen zu untersuchen:

  1. Veränderung in der Ultrastruktur der Synapse: Insbesondere interessiert uns die Analyse der dreidimensionalen Architektur der Zytomatrix von präsynaptischen und postsynapatischen Terminalen und der molekularen Struktur des synaptischen Spalts spezifischer inhibitorischer Synapsen sowohl beim normalen Alterungsprozess als auch bei neuronalen Störungen und altersbedingten Demenzen (z. B. der Alzheimer Krankheit).
  2. Ein besseres Verständnis des Mechanismus der Autophagie bei neurodegenerativen Erkrankungen auf ultrastruktureller Ebene: Die Identifizierung von Autophagosomen in Neuronen hat eine Debatte darüber hervorgerufen, ob dieser Prozess zu einer neuroprotektiven Reaktion beiträgt oder den  Zelltod einleitet. Wir glauben, dass unsere EM-Techniken wichtige strukturelle Einblicke in die Entstehung der Membran-Struktur der Autosomen liefern werden und in die autophagischen Prozesse unter normalen und krankhaften Bedingungen.

Publikationen

Structural studies on desmosomes.

Al-Amoudi, A.  and Frangakis, A. (2008), Biochem. Soc. Trans. 36, 181-187.

The molecular architecture of cadherins in native epidermal desmosomes.

Al-Amoudi, A., Díez, D., Betts, M. and Frangakis, A. (2007), Nature 450, 832-837.

Fiducial-less Alignment of Cryo-Sections.

Díez, D., Al-Amoudi, A., Glynn AM, and Frangakis, A. (2007), J. Struct. Biol. 159, 413-423.

CEMOVIS. Cryo-electron microscopy of vitreous sections In Modern cryo-preparation methods for electron microscopy.

Dubochet, J., Al-Amoudi, A., Bouchet-Marquis, C., Eltsov, M., Zuber, B. (2007), eds. A. Cavalier, B. M. Humbel and D. Spehner): CRC Press

How to "read" a vitreous section.

Dubochet, j., Zuber, B., Eltsov, M., Bouchet-Marquis, C., Al-Amoudi, A., Livolant, F. (2007), Methods Cell Biol. 79, 385-406.

Cutting artefacts and cutting process in vitreous sections for cryo-electron microscopy.

Al-Amoudi, A., Studer, D.,  and Dubochet, J. (2005), J. Struct. Biol. 150, 109-121.

Nanostructure of the epidermal extracellular space as observed by cryo-electron microscopy of vitreous sections of human skin.

Al-Amoudi, A., Dubochet, J., and Norlén, L. (2005), J Invest Dermatol. 124, 764-77.

PhD thesis: Cryo-electron microscopy of vitreous sections of native biological cells and tissues.

Al-Amoudi, A. (2004), Faculty of biology and medicine, University of Lausanne, Switzerland

Cryo-electron microscopy of vitreous sections.

Al-Amoudi, A., Chang, J. J., Leforestier, A., McDowall, A., Salamin, L., Norlén, L., Richter, K., Sartori Blanc, N., Studer, D. and Dubochet, J. (2004), EMBO J. 23, 3583-3588.

Stratum Corneum Keratin Structure, Function, and Formation: The Cubic Rod-Packing and Membrane Templating Model.

Norlén, L. and  Al-Amoudi, A. (2004), J. Invest. Dermatol. 123, 715-732.

Cryo-electron microscopy of vitreous sections of native biological cells and tissues.

Al-Amoudi, A., Norlén, L., Dubochet, J. (2004), J. Struct. Biol. 148, 131-135.

Cryo-Transmission Electron Microscopy of Frozen-Hydrated Sections of Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa.

Matias, V., R.,  Al-Amoudi, A.,  Dubochet, J., and Beveridge, T., J., (2003), J. Bacteriol.  185, 6112-6118.

An oscillating cryo-knife reduces cutting-induced deformation of vitreous ultrathin sections.

Al-Amoudi, A., Dubochet, J., Gnaegi, H., Lüthi, W. and Studer, D. (2003), J. Microsc. 212, 26-33.

A rapid microbiopsy system to improve the preservation of biological samples prior to high-pressure freezing.

Vanhecke, D., Graber, W., Herrmann, G., Al-Amoudi, A., Eggli, P. and  Studer, D. (2003), J. Microsc. 212, 3-12

A cryotransmission electron microscopy study of skin barrier formation.

Norlén, L., Al-Amoudi, A., and Dubochet, J. (2003), J. Invest. Dermatol. 120, 555 - 560.

Amorphous solid water produced by cryosectioning of crystalline ice at 113 K.

Al-Amoudi, A., Dubochet, J., and Studer, D. (2002), J. Microsc. 207, 146-153.

A new approach for cryofixation by high- pressure freezing.

Studer, D., Graber, W., Al-Amoudi, A., Eggli, P. (2001, J. Microsc. 203, 285-294.